团队围绕水稻遗传改良这一总体目标，立足国际学科前沿，将分子生物学技术与常规技术紧密结合，解决水稻遗传改良中的重大科学问题，为作物遗传改良提供新理论、新技术、新基因、新资源，为水稻生产提供新品种。经过长期积累，团队凝练出水稻功能基因组和绿色超级稻两大科学目标并取得标志性成果；提出并践行“双水双绿”重塑鱼米之乡；围绕绿色营养健康水稻产业链布局创新链，提倡“黑米主食化”，引领作物基因组育种范式。

团队由张启发院士领衔，熊立仲教授为团队运行负责人。目前团队成员30人，20名教授、8名副教授和2名助理研究员。其中中国科学院院士1人，长江学者特聘教授3人，国家杰出青年科学基金获得者3人，国家优秀青年科学基金获得者4人，青年长江学者3人，青年拔尖人才3人，水稻产业技术体系岗位科学家2人。团队分别于2004年和2018年获得国家自然科学基金创新群体计划支持，“基因组研究与水稻遗传改良”（2004-2012）是国内生命科学领域唯一一支连续3次获得国家自然科学基金资助的创新研究群体。

共获得国家自然科学二等奖2项，湖北省自然科学一等奖6项，获“农业转基因生物安全证书”2项。近5年在Nat Rev Genet、Genome Biol、Nat Plants、Nat Commun、Mol Plant、PNAS、Plant Cell等期刊上发表研究论文258篇；获批国家发明专利86项；审定水稻品种14个。