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高通量测序平台
来源: 时间:2023-05-17

高通量测序平台拥有华大智造和Illumina两大测序平台,以华大智造DNBSEQ-T7、MGISEQ-2000和Illumina HiSeq3000测序仪为核心,辅以全自动核酸分析仪、DNA片段分离系统和自动化样本处理系统等配套仪器。专业提供高通量测序相关技术服务,主要包括:基因组测序、转录组测序、全基因组甲基化测序、ChIP测序、Small RNA测序等。

平台以基因组学研究和应用开发为宗旨,致力于为科研人员提供创新的基因组学研究方案和可靠的实验数据,立志于加速科研人员在生物、农业领域的科学发现,推动生命科学、农业育种、食品安全和医药等领域的发展。

仪器设备:

Illumina HiSeq3000高通量基因测序系统

华大智造MGISEQ-2000基因测序仪

华大智造DNBSEQ-T7基因测序仪

代表性支撑成果:

1. 玉米团队严建兵课题组联合美国加州大学戴维斯分校等单位通过构建玉蜀黍的遗传变异图谱,揭示了玉蜀黍适应性进化的调控机制。该研究鉴定出大量玉米中缺失的适应性等位基因,有潜力通过重新引入遗传多样性来加速未来的育种(Chen et al.,Nat Genet,2022)。

2. 棉花团队王茂军、金双侠课题组在前期组装的陆地棉TM-1和海岛棉3-79的高质量参考基因组基础上,对1913份棉花样本构建了目前变异类型最丰富的棉花遗传变异组,为棉花重要性状的生物学研究提供了新的基因位点,从泛基因组学的角度为棉花重要性状的精准改良提供了新的思路(Li et al.,Genome Biol,2021)。

3. 油菜团队郭亮课题组联合生物信息团队谢为博课题组首次在油菜中将eQTL和染色质可及性相结合,利用了856个RNA-seq和59个ATAC-seq数据,全面描述了油菜种子发育过程中的转录变异调控图谱,并结合机器学习与深度学习算法挖掘了油菜种子含油量调控新基因,为多倍体植物的不对称调控提供了借鉴(Tan et al.,Genome Biol,2022)。

4. 水稻团队李兴旺课题组在前期系统地解析了水稻等模式植物不同组织的线性表观基因组和三维基因组结构的基础上,进一步绘制了水稻昼夜动态变化的高分辨三维基因组图谱,系统阐释了昼夜动态变化的三维基因组结构对节律基因转录调控的影响,对水稻遗传改良和其他经济作物的研究有重要的指导意义和科学价值(Deng et al.,Genome Biol,2022)。